
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
的研究最后
探索工作人员探求随食品冷库周期廷长牛羊肉的氏抗拉强度、持反击式水轮机、质地、矿酸铁占比、ROS、脂质过腐蚀物、MDA、GSH和GPX4平行来评价手臂肌肉组织开展上皮体细胞的铁自杀环境。最终体现,食品冷库周期廷长后,牛羊肉的氏抗拉强度在第5天和第6天差异性性回落;持水力较低;外表颜色变深,丢掉亮泽,鲜蓝色换成暗蓝色。还有就是,矿酸铁、活力氧和MDA的占比差异性性增强,上皮体细胞凋亡率差异性性增加。 探究者去除的各不相同速冻五代十国时期的胸肌图纸的核膳食纤维,接着做SDS-PAGE了解,核膳食纤维条带在的各不相同五代十国时期生长竖直且是类似的(图1a)。可根据核营养素在的各不相同图纸中的理解条件,了解显示相同个组图纸的中四位数取决于于相同个级别(图1b),证明胸肌图纸核膳食纤维享有优异的组内是类似的性和组间之间的关系性。 血清质组学共签定出1996种血清质。以B0为差表组,淘汰B1、B2、B4和B6中的血清通过对比理解出具体方法进行具体分析,共签定到3715个DEPs。将火山图交互式,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两人规范进行具体分析DEP。的的结果如图甲如下图所示1c-f如下图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别签定出22、33、73和140个DEPs,中间分刘海别上涨6、11、32和815个,下降16、22、41和5俩个。聚类分析具体方法风险评估了不相同冷冻时段全身力量组识中血清质的理解出具体方法,的的结果现示全身力量血清理解出具体方法对比逐渐永久保存时的加剧而加剧(图1g)。
图1| 有所差异冷库时候的相关肌肉样件蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有不同冷冻日期的相关肌肉合格品不同蛋白质分折(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡蛋白酶肽的PRM参考值介绍(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG生物富集差距表示血清的铁阵亡管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT一定量血清质组学方法功能,拜谱生物制品已科研开发结束并加入了健全完善的转录组学、血清组学、产生组学及及多个学联席成品方法功能体系建设,欢迎致电咨询!
参考使用学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.