草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿体系最先见的传染性疾病组成。肾团队中CaOx结晶体过饱合沉淀会致使肾小管组织细胞损坏和凋亡，才能致使肾结石的会产生。短链肌肉酸由可以使肠胃内生物滤池大肠杆菌厌氧发酵营养粗纤维棉会产生，往往在边缘可以使肠胃第一道防线中展现帮助，所以在体系标准上也展现重点帮助。进来，丁酸是最多的短链肌肉酸，具有着天然免疫抑止和天然免疫抑止帮助,本探究探究丁酸对CaOx肾结石的帮助还有潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山门诊泌尿普外吴忠副教授、周子健博后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网咯药剂学学产品，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

新闻稿件名号：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客服机关单位：华山大医院 调查文本：大鼠、HK-2癌细胞 好友分组资料：相较比较组（Con）、模型工具组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示工艺：线上药剂学学检验

工作思路工艺流程

探讨结局

实验技术人员关键在于搭建大鼠模式化，在内分泌系统什么是生化因素和组织性方面的问题学固色等实验技术挖掘丁酸不错减掉CaOx模式化大鼠肾CaOx晶胞的产生和破损，有所改善CaOx模式化大鼠的炎症病变破损和空气硫化化合物的频繁表答。再者，丁酸还可控制性草酸诱导型的HK-2細胞破损、空气硫化应激状态和細胞凋亡。 为探索丁酸的形式和靶表观遗传组组网数据上，研发员工从PubChem调用丁酸和丁酸酯的二维和立体的形式（图1A）。能够PharmMapper的数值和Uniprot的数值治疗后共建立出117个丁酸靶表观遗传组组供进一歩了解。将表观遗传组组详实信息拷贝到STRING的数值，去PPI网数据上了解。Cytoscape总结出了编排的前20的交通核心区靶表观遗传组组的详实网数据上图，属于CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这个交通核心区表观遗传组组与网数据上中的同一表观遗传组组均体现出有一定的相关系性，表达这个表观遗传组组可以挥发着协同作战功用。GO和KEGG了解阐述了丁酸交通核心区表观遗传组组的相关系经由和生态学学用途（图1C）。交通核心区表观遗传组组常见与类固醇荷尔蒙初次初次应答、氧化物发生不起目的应激状态状态初次初次应答、电学活化氧体细胞对类固醇荷尔蒙有趣的发生不起目的相应对强酸电学的物质的发生不起目的相关。提出的提出的，这个交通核心区表观遗传组组常见参予了氧化物发生不起目的应激状态状态和对电学活化氧的生态学发生不起目的过程中 ，是肾结石行成长效机制中至关更必要的经由，这表达丁酸可以在肾结石中挥发更必要功用。

图1| 丁酸结构特征与靶dna微信网络数据分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进那步探究丁酸对CaOx肾结石.切靶表观遗传，探究有关考生巧用GEO的资料系统库对GSE73680中营养对比与CaOx肾结石病人的表观遗传不一致性开展了探究。对比组与CaOx结石病人的正有关性不一致性展现表观遗传（DEGs）检查标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个表观遗传时有发生正有关危害，在当中3379个（89.4%）表观遗传展现调整，404个（10.6%）表观遗传展现变动（图2A）。对DEGs开展聚类分析法具体分析具体分析，热图现示了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析法具体分析优点（图2B）。随即，探究有关考生对其进行GeneCards的资料系统库技术人群鉴定费了370个很有可能与CaOx肾结石有关的表观遗传，排在前20位的預測表观遗传试述有关性评分标准下图2C下图。为了能够找自己丁酸治愈CaOx肾结石的重点靶点，探究有关考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关表观遗传处置能够得到一个Venn图。从而，CYP2C9被认定为丁酸危害CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。还有，探究有关考生还开展了丁酸与CYP2C9的氧分子连接，CYP2C9的两个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸完美帮助，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在应用网络上药学学予测CYP2C9是丁酸的影响CaOx肾结石的靶DNA后，探究工作人员还顺利通过血内部实验室查证了CYP2C9可拉低草酸引诱的HK-2血内部的ROS横向、宫颈炎症断裂和凋亡。

图2| 普遍据库合作研究分析CYP2C9是丁酸效果于CaOx肾结石的靶遗传基因

实验最终

本工作要发掘丁酸在离体和身上均能抑止CaOx肾结石型号的防腐蚀应激反应性和宫颈发炎磨损，马上又采用电脑网络上临床药学学筛分得出丁酸不良影响CaOx肾结石的隐藏的靶点——CYP2C9，接下来采用体细胞核工作否认CYP2C9在草酸盐诱惑的HK-2体细胞核ROS高技術、宫颈发炎磨损和凋亡。一些发掘反映丁酸会采用抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的防腐蚀应激反应性，改善宫颈发炎磨损。此种操作过程中拜谱动物提供了了电脑网络上临床药学学高咨询了解服务管理于，凡此种种拜谱动物可上升成长落实的什么是基因组学、血清质组学、代谢转化组学等两组学软件及高咨询了解服务管理于，热情接待详询咨询了解！ 可以参考期刊论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.