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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体鱼类特喜欢的人、寡核苷酸体现人工成本昂贵或的操作工作流程僵化。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导人员在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低的成本、跨鱼类、全电商平台兼容的全新解决方案。

刊物介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由全国科学学有效有效院基因基因病规律性与发育状况菌物学探析所和全国基因基因病规律性懂得主办单位的国际性学界讨论刊物,迫切需要打造于通讯稿我的生命科学学研究探讨有效有效和医美基因基因病规律性学区域的原创度性探析成效。JGG 2021年度作用指数公式7.1,Scopus学界讨论刊物评论依据CiteScore 9.9,排第JCR 2021年度GENETICS & HEREDITY区域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY区域Q1区,排第全国科学学有效有效院刊物系统盘菌物学类项1区(Top刊物),基因基因病规律性学和生物技术化学与团伙菌物学小类双1区。

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一些 是HEATag

有效的“二一体化”的设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶分为的容合淀粉酶

「精准定位器」模组 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化遮盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「进行射频连接器」接口 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索长条形码查询开展共价接入。

“1+1>2”的郊果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品标注与朔源。

Fig1: HEATag多大标志原因示幼儿小班教案图

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HEATag真不知道有多用打?

是可以在不一必要条件下,保证喂奶家禽細胞系单細胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。分析精英团队为 HEATag 设立了多轮 “压力值检测”,从受损组织系到受损组织核,从常温下到温度低,从新鲜范例到统一范例,全方面检验它的相对稳定量分析和能信性。

1轮测试测试真对哺乳期爬行动物神经細胞核系:调查职工的选择了是来自于人、鼠、仓鼠几个植物外来动物群的4种神经細胞核(HEK293T、K562、MEF、CHO),在空调温度下要 HEATag 标记符号后混和测序。不可能回收处理的 11447 个神经細胞核中,85.66% 都能完成 HEATag 长条码精准的输入到原植物外来动物群,样例间交错污染问题稀少,UMAP 聚类算法探讨同时也是真接单位证明,HEATag 长条码与植物外来动物群特男人人类基因组特色宽度一样。 之后,测试测试环境进十步升级成:探析者试试看在 4℃下图标新的的肿瘤神经元、在制冷下图标甲醇一定的肿瘤神经元,以至于可直接图标肿瘤神经元核。最终结杲依旧会显眼:每个环境下,样例标签设计与动物群信息均体现了比较好的有关性,拆成精确度率超 95%。虽然甲醇一定的会形成一些的转录本对称危害,肿瘤神经元核化学合成就有少许 RNA 流动,肿瘤神经元多种类型的批注最终结杲依旧会与新的的样例长期保持统一,说明 HEATag 可图标各个处里环境下的实践样例。

Fig2: HEATag 可在不一样环境下进行单神经细胞转录组混样阐述

能标志辅乳期猎物和海洋环境无脊柱猎物的原代細胞

假设说細胞系测试测试是 “的基础题”,那进行范本是 “额外添加题”, 等等范本总是因細胞类型、错综复杂、环镜自我调节性层次性,成为了标上技艺的 “重思路”,而 HEATag 恰巧在等等 “重思路” 上出现了其优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸安排,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞往往能被精准辨别,其它首要神经元类型、的聚类分析的结果都分明可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海域菌物的匹配性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长商品条形码与鱼类转录组含有较高独立性性,还没有发生因高盐室内环境会造成的 “标识已过期”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可保证母乳喂养昆虫组织化子样本重量 scRNA-seq 概述

Fig4: HEATag可实行新鲜感海域无脊椎神经各种动物各种方面 scRNA-seq 分享

HEATag与癌细胞的融合不可能影响转录组的可观改变了

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完毕图标作业的而且,不对后面的转录酚类化合物析构成电磁波辐射,保障了研究分析大数据的实际性。

Fig5: HEATag不是不良影响样表的 RNA 表答经济模式

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未来发展可期

HEATag 能为单体细胞论述带来了任何?

HEATag 的作用,远只有于 “解決标识相关问题”,它的机灵性和普遍意义,目前在为单内部钻研拉开更加几率性

从应运情景方面看

HEATag 能包括从 “简便更加概述”(如癌企业做好与正常情况下企业做好、口服药补救与对比)到 “大整体产值探究”(如企业做好血细胞系图谱绘图、高通芯片量筛分)的全超范围需要量。近年来 PIP-seq、Stereo-cell 等创新型可拓展系统的趋势,HEATag 还能进1步提升自己单血细胞系探究的通量,机械助力科技研究队伍做好更广整体产值的投资项目。

从跨科技领域潜质来讲

HEATag 并不是符合于转录组学,还能与表观基因遗传组学、蛋清质组学、余地组学等技木融合,利用订制检索和寡核苷酸队列,HEATag 行轻松愉快融入到各种不同的组学标准流程,不影响到4g信号捕捉深浅。同时,应用于HEATag还行发展方向单受损细胞糖组学论述技木。

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协作的动态

拜谱动物与陈凯院士达到目标阶段合作的意料之外

非常值得瞩目的是,在 HEATag 工艺凸显出极大用途潜质的视频背景下,拜谱微海洋环境生物制品已与湖南省地区海域科学课与建筑项目湖南省科学试验室(南京)陈凯传授完成开始区域合作购房意向。双方彼此年度计划着力 HEATag 工艺的文化全产业链下地、科技创新变为等方位选取厚度区域合作,带动相应高效、性价比最高率费、跨种类的单组织箭头工艺最快用途于实计科技创新场所,为更加科学试验室提供数据高效、性价比最高、经济增长的单组织钻研工具软件,动力科技创新岗位者在组织微海洋环境植物学、海域微海洋环境植物学、病系统等行业获得更加翻过
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